הרפ מותר להניח תפילין אחרי שהוצאת זרע לבטילה בלילה(בלי מקלחת)

כן. מצוה היא מצוה. היא לא תלויה בעבירות. תיטול ידיים כמו כל בוקר ותניח תפילין